1. 域名的侵权纠纷案件是指因为某个域名侵犯了他人的合法权益，引发的法律纠纷。那么，根据我国的相关法律规定，域名的侵权纠纷案件由法院来管辖。

2. 据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十二条之规定，人身权，财产权，离婚和继承的纠纷，以及其他需要审判机关裁决的案件，均由人民法院管辖。

3. 在域名侵权纠纷案件中，侵权一方首先可以向人民法院提起诉讼。根据《最高人民法院关于适用<民事诉讼法>的解释》第二十一条之规定，人民法院对其管辖范围内的第一审案件有管辖权。

4. 在判决过程中，法院将综合考虑双方的申请、答辩和证据，最终做出裁决。如果双方不服判决，还可以向上级法院提起上诉。

5. 值得一提的是，在域名的侵权纠纷案件中，如果侵权方为境外主体或者涉及到国际争议，可能会涉及到国际私法和国际仲裁等相关法律规定。国际争议需要借助于国际仲裁机构来解决。

总结：域名的侵权纠纷案件由人民法院来管辖。双方可以通过向法院提起诉讼，最终获得法院的裁决。如果涉及到国际争议，可能需要借助于国际仲裁来解决。保护域名的合法权益，需要依靠法律来维护。