商业承兑汇票是一种商业交易中常用的支付方式，虽然具有很大的便利性，但也存在一定的风险。商业承兑汇票的背书环节有可能出现问题。如果承兑人无力偿付或违约，背书人会面临损失。商业承兑汇票还可能存在政策风险。如果国家出台政策限制商业承兑汇票的使用或改变承兑人的地位，持票人的利益可能受到损害。此外，商业承兑汇票的期限较长，也存在逾期风险。

为了有效管理商业承兑汇票的风险，首先需要做好合作方的背景调查。了解承兑人的信用状况、经营情况和还款能力，可以减少承兑人违约的风险。在背书环节，也要进行严格的审核，确保背书人的信用和资质可靠，以减少背书环节的风险。

公司需要制定完善的内部控制制度。这包括建立风险管理制度、审计制度、资金监控制度等。通过健全的内部控制制度，可以提高商业承兑汇票流程的透明度和规范性，减少内部操作风险。

此外，拥有风险管理工具也是很重要的。例如，公司可以购买保险来规避商业承兑汇票的风险。保险公司可以提供提前核查承兑人信用情况、支付保证金等服务，以减少可能的违约风险。

加强与金融机构的合作也能有效管理商业承兑汇票的风险。与银行合作，可以减少资金周转周期，降低逾期风险。同时，金融机构能够提供专业的风险管理服务，为企业提供风险分析、催收等支持。

商业承兑汇票具有一定的风险，但通过背景调查、内部控制制度、风险管理工具以及与金融机构的合作，我们可以有效地管理这些风险，以保障企业的利益。