1. 刑事案件非法低价出让国有土地使用权犯罪的立案追诉程序需要遵循相关法律规定。首先，相关部门需对该案件进行立案审核，并确定案件主管机关和办案人员。

2. 立案后，办案人员应收集相关证据并进行审查，包括行政许可证件、土地估价报告、交易协议等相关文书，以及参与出让的相关人员证言等。并对涉嫌犯罪的人员进行调查取证，确认其在出让过程中的作用和行为。

3. 在调查取证工作完成后，办案人员应制作调查报告，并提交给案件主管机关审批。经主管机关批准后，办案人员可以对涉嫌犯罪的人员采取强制措施，包括传唤、拘留、搜查等手段。

4. 在强制措施执行过程中，办案人员应确保被调查人的合法权益。对于强制措施的使用必须具备足够的法律理由和法定程序，不能对被调查人进行任何形式的侵犯。同时，对于因被调查人行为受到影响的其他相关人员，应予以必要的安抚和保护。

总之，对于刑事案件非法低价出让国有土地使用权犯罪的立案追诉，需要遵循严格的立案和侦查程序，同时确保被调查人的合法权益，落实相关法律规定，维护社会公正和法制稳定。